荷兰司令雅科布·考乌统率10艘战船，经过33多天的航行，于五月十八日到达台湾海面。
揆一等堡内荷军得知此消息后，欣喜异常，以为可以内外夹击，一举击退郑军！
不料考乌见郑军战船阵容雄壮，而自己带的援军兵力有限，觉得援救热兰遮城已无济于事，于是踌躇不前，
加之风浪很大，考乌只好带领的荷舰被迫离港，远泊海外达二十八日之久。
在风平浪静之后，才有5艘战船在热兰遮城附近海面碇泊，其余的要么如厄克号那样，触礁沉没了，要么则是被郑军的训练船俘获。
这批援军的到来，使困在热兰遮堡中的荷军空喜欢了一场。
舰队只载来七百名援军过来，显然不会使他们的处境比战争开始时更好，更何况现在还未做任何事，就意少了一半人？
时间的推移，使城堡内的荷军精疲力竭，患病的人数增加，绝望的情绪漫延开来。
而另一边，郑锦从俘虏口中得知荷兰援军兵力情况后，加紧进行围城和打援部署。
七月二十一日，热兰遮城的荷军总督揆一决定：
用增援的舰船和士兵，把郑军逐出热兰遮城市区，并击毁停泊在赤嵌城附近航道上的郑军船只，以摆脱被围困境。
荷军最终分水、陆两路向郑军发起进攻。
在海上，荷舰企图迂回郑军侧后，焚烧船只，反被郑军包围。
郑水军隐蔽岸边，当敌舰闯入埋伏圈后，立即万炮齐发。
经过一小时激战，击毁荷舰两艘，俘获小艇三艘，使荷兰援军损失了一个艇长，一个尉官，一个护旗军曹和128名士兵，另有一些人负伤。
荷军其余舰船逃往巴达维亚。
在陆战方面，士气低迷的荷军就更不是郑军的对手了，他们的进攻没能持续半小时，便被郑军轻松击溃。
热兰遮城的荷军被围数月，军粮得不到补给，此时援军又失，因而士气再次大为跌落，都不愿再战。
其实这个时候发动强攻的话，郑锦还是很有把握攻破热兰遮城的。
但他不愿徒耗人力，所以打算再多围困一些时日，以待更好的进攻时机出现。
揆一为了挽救行将灭亡的命运，企图与清军勾结，夹击郑军。
他派出的使者到了福建后，提出了请求，然而清军却要荷兰人先派战舰帮助他们攻打厦门，然后再解荷军之围，
揆一无可奈何，只好派雅科布·考乌率领漂泊在海上的3艘战舰、2只小艇前去攻袭厦门。
考乌心存畏惧，觉得这无异于是送死，竟直接中途转舵驶向暹罗，以后又逃回巴达维亚去了。
于是，荷军勾结清军夹击郑军的企图完全落空了，士气更加低落，不少士兵力求活命，陆续向郑军投降。
郑锦从俘虏中了解到荷军的上述情况后，终于决定把对荷军的封锁战术转为进攻，
为此，郑军增建了三座炮台，挖了许多壕沟，以遏制荷军的炮台。
不久后，又一批荷兰守兵在军曹拉迪斯带领下，出城向郑军投降。
他们不仅讲述了热兰遮城内的详细情况，还提出了两条建议，
一条是充分利用围城内普遍存在的惊慌情绪和疲弱状态，不仅要用封锁，而且要用连续攻击，来彻底疲惫敌人，使其完全绝望。
这样做既不费事，又不需要很长时间，因为城堡建筑得很坏，经不起大炮猛轰两个整天。
另一条建议是先攻占热兰遮堡旁边小山头上的乌德勒支圆堡，取得制高点。
这点郑锦早有筹划，而曹拉迪斯则为他的进攻计划变得更完善了一些。
随后，郑锦立即调集军队，配备了二十八门巨炮，开始攻坚战役。
一时间沉寂多时的热兰遮城一地，再次响起了震耳欲聋的炮响
在两个小时内，郑军发射炮弹2500发，率先在该堡南部打开了一个缺口，
1659年9月初一，经过激烈的战斗，在付出了上百条人命后，郑军终于强占了乌特勒支圆堡，
负责领兵攻打此堡垒的将来黄安，甚至手臂都中了一枪，接下来都需要好好静养才行。
可见这种堡垒，是多么的不好打！
荷兰人在如此的劣境之下，仍让郑军付出了不小的代价，才将这乌德勒支堡啃了下来。
郑军居高临下，立即利用此堡改建炮台，向热兰遮城猛烈轰击。
荷军团守孤城，岌岌可危，揆一在城上督战，看到城防已被突破，手足无措。
在这种情况下，郑锦派通事李仲入城劝降。
自乌德勒支堡打下来后，热兰遮城内的所有人，就算是傻子都明白他们统治从岛的末日已经来临，
揆一同评议会的成员经过一天一夜的会议，反复权衡利弊之后，终于决定：趁早把城堡交与敌人，争取优惠条件，是为上策。
在评议会一致同意下，揆一派出使者向郑锦接洽投降事宜。
揆一的投降协议书里，罗列了八条协议：
第一条：双方停止一切敌对行动，从此不记前仇。
第二条最重要：荷方应将热兰遮城堡、外堡、大炮、剩余的军用物资、商品、现金以及其他属于公司的财产，全部交与郑王世子殿下。
第六条：经检查后，荷兰士兵得以在长官指挥下，扬旗、鸣炮、荷枪、击鼓、列队上船。
此外，允许荷兰人携带私人钱财和航行往巴达维亚途中所需的各种生活用品；殖民当局的档案可以运走；双方交换俘虏。
条款虽不少，但揆一等人显然也明白自己现在实在没什么本钱讨价还价，除了要求带走私人钱财外，并没有太出格的请求。
而他们那点私人钱财，郑锦实在是看不上眼。
更何况，什么是私人钱财，什么又是公司的财产，等城门打开后，还不是郑锦说了算？
所以郑锦爽快的答应了荷兰人的投降协议，
等双方的代表按照手续签了字后，满脸疲态的荷方战士便全副武装，举着白旗列队从城堡走出，
这座荷兰在台湾的最后一座堡垒，就此升起了郑军的旗帜，整座岛屿在被荷兰侵占数十年后，终于再次回到了华夏的怀抱
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